题目内容：
（四） 某大型超市与甲公司有长期商品供应合同，超市缺货时，甲公司需快速将需要的商品送到，合同规定货到验收合格付款。2019年5月25日超市要求甲公司为其发送一批海鲜，5月26日该批海鲜运到后发现冷冻车的制冷系统出现了问题，全部产品均已腐烂，并发出刺鼻气味，已不能再食用。根据合同规定，超市于当日提出退货，甲公司同意退货，但甲公司已开具增值税专用发票，只是未作账务处理，并责成司机将发票联和抵扣联带到了该超市。 其他资料：该超市和甲公司均为增值税一般纳税人。 要求： (1)根据上述资料，甲公司同意退货发票应作何处理？ (2)如果超市拖延至6月2日提出退货申请，并且发票已经勾选确认申报抵扣，甲公司同意退货，双方应就发票作何处理？
答案解析：